城市軌道交通在實施過程中會涉及到諸多涉水問題：軌道交通線路、進出口有防洪要求 ， 需要對軌道交通線路進行洪水影響評價，軌道交通在下穿河勢變化相對復雜河道時，為確定穿江隧洞的安全頂標高，需要開展線位最大沖刷深度的研究，輕軌線路設施在占用水域時， 需要開展對河道行洪影響的評價及補償措施研究。

2010年至今， 我院承擔了寧波市軌道交通所有已建或在建的5條線路的洪評， 主持8個下穿線位最大沖刷深度的研究和2處大型跨河橋梁的行洪影響評價研究。2013年 在寧波遭受菲特臺風重大洪澇災害的情況下，經我院評價實施的軌道交通1號線工程未產生內澇積水，保障了地鐵工程安全，獲得了業主單位的肯定。